Introduite en 1999 pour l'année modèle 2000 et pour souligner le cinquantième anniversaire de la marque Honda, la S2000 fut développée par les mêmes ingénieurs qui avaient travaillé sur l'Acura NSX. En fait, le projet S2000 a vu jour au milieu des années 90, quelques temps après la sortie de la NSX.