La petite Yaris nous revient en 2009 avec quelques petits changements d'ordre esthétiques. Ces derniers sont davantage visibles sur la version RS, qui se voit attribuée un nouvelle ensemble de jupes aérodynamiques, ainsi que de nouvelles jantes. Les autres versions ne se contentent que de discrètes modifications à la calandre et aux pare-chocs. La Yaris est également proposée pour 2009 avec un système de navigation TomTom optionnel, lequel est intégré à la radio et qui plus est, amovible. Voilà une caractéristique que les autres rivales ne proposent pas.